Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR4A1P22736 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms