Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms