Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUP10909 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUP10909 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUP10909 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUP10909 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUP10909 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUP10909 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUP10909 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUP10909 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUP10909 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUP10909 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUP10909 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUP10909 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUP10909 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUP10909 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUP10909 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUP10909 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUP10909 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUP10909 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUP10909 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUP10909 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUP10909 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUP10909 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUP10909 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUP10909 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUP10909 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUP10909 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUP10909 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUP10909 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUP10909 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUP10909 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUP10909 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLUP10909 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLUP10909 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLUP10909 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms