Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms