Protein–RNA interactions for Protein: P04279

SEMG1, Semenogelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMG1P04279 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMG1P04279 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms