Protein–RNA interactions for Protein: O76031

CLPX, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPXO76031 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPXO76031 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPXO76031 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPXO76031 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPXO76031 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPXO76031 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPXO76031 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPXO76031 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPXO76031 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPXO76031 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPXO76031 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPXO76031 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPXO76031 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPXO76031 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPXO76031 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPXO76031 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPXO76031 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPXO76031 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPXO76031 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPXO76031 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPXO76031 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPXO76031 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPXO76031 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPXO76031 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPXO76031 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPXO76031 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPXO76031 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPXO76031 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPXO76031 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPXO76031 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPXO76031 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPXO76031 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLPXO76031 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLPXO76031 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLPXO76031 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLPXO76031 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLPXO76031 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLPXO76031 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLPXO76031 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLPXO76031 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLPXO76031 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLPXO76031 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLPXO76031 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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CLPXO76031 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPXO76031 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPXO76031 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPXO76031 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPXO76031 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPXO76031 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPXO76031 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPXO76031 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPXO76031 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPXO76031 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPXO76031 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPXO76031 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPXO76031 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPXO76031 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPXO76031 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPXO76031 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPXO76031 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPXO76031 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPXO76031 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPXO76031 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPXO76031 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPXO76031 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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