Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms