Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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