Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRPO00591 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRPO00591 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRPO00591 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRPO00591 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRPO00591 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRPO00591 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRPO00591 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRPO00591 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRPO00591 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRPO00591 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRPO00591 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRPO00591 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRPO00591 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRPO00591 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRPO00591 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRPO00591 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRPO00591 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms