Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms