Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms