Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
C9orf92A6NGG3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms