Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P9

SPEF1, Sperm flagellar protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF1Q9Y4P9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms