Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 DUSP10-201ENST00000366899 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms