Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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