Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms