Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms