Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN11AQ9UI33 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN11AQ9UI33 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN11AQ9UI33 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN11AQ9UI33 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms