Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms