Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms