Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms