Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQL9

DMRT3, Doublesex- and mab-3-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMRT3Q9NQL9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRT3Q9NQL9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms