Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms