Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms