Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM7

PINK1, Serine/threonine-protein kinase PINK1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PINK1Q9BXM7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PINK1Q9BXM7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms