Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCF25Q9BQ70 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCF25Q9BQ70 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCF25Q9BQ70 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCF25Q9BQ70 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCF25Q9BQ70 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCF25Q9BQ70 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms