Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms