Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms