Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

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Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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PKP4Q99569 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PKP4Q99569 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PKP4Q99569 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PKP4Q99569 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PKP4Q99569 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PKP4Q99569 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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PKP4Q99569 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PKP4Q99569 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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