Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms