Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZA3Q96KX2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms