Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms