Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 LINC-PINT-208ENST00000451786 3505 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 GMFB-201ENST00000358056 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 CCBE1-202ENST00000439986 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms