Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTHRC1Q96CG8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms