Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms