Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms