Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms