Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVB6

CHTF18, Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18Q8WVB6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHTF18Q8WVB6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms