Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms