Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms