Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms