Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms