Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms