Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms