Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms