Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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