Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms