Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
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