Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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PCM1Q15154 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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PCM1Q15154 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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PCM1Q15154 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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PCM1Q15154 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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PCM1Q15154 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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PCM1Q15154 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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PCM1Q15154 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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PCM1Q15154 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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PCM1Q15154 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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PCM1Q15154 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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PCM1Q15154 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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