Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
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SCARF1Q14162 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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SCARF1Q14162 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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